Misato arriveert met haar anti-NERVe-groep Wille in Parijs, dat rood is door toedoen van core-ization. Het vlaggenschip Wunder landt op de toren. Ze hebben maar 720 seconden om de stad te herstellen. Als een horde NERV Eva’s verschijnt, moet Mari’s verbeterde Eva Unit 8 in actie komen. In de tussentijd dwalen Shinji, Asuka en Rei door Japan.